소아 류마티스 관절염 진단용 바이오마커 및 인간 백혈구 항원 대립 유전자 유형

Abstract

소아 류마티스 관절염 (juvenile idiopathic arthritis, JIA)은 자가 면역 질환 (autoimmune disease, AID)으로 알려져 있으나 정확한 발병 원인은 여전히 불분명하다. 위험 변이에 의해 영향을 받는 JIA 감수성 유전자를 발굴하기 위해, 본 연구에서는 JIA의 전장유전체 연관분석 연구 (genome-wide association study, GWAS)를 발현 정량적 형질 유전자좌 (expression quantitative trait loci, eQTL) 데이터와 통합하여 전장전사체 연관분석 연구 (transcriptome-wide association study, TWAS)를 수행했다. 이를 통해, 4개의 새로운 유전자를 포함하여 소아 류마티스 관절염의 위험과 관련된 19개의 중요한 유전자를 발굴했다. 전장전사체 연관분석 연구와 함께, 소아 류마티스 관절염 병인에 대한 HLA 영역의 기여에 관해 연구하기 위해 RNA 시퀀싱 데이터 세트를 사용하여 인간 백혈구 항원 (human leukocyte antigen, HLA) 대립 형질 유형 (allele type) 분석을 수행했다. HLA-DRB1*04:01 및 DRB3*02:01은 소아 류마티스 관절염 환자에서만 10% 이상의 빈도를 나타냈다. B*40:01은 백인 소아 류마티스 관절염 그룹에서 더 빈번하게 나타났으며 DRB1*15:03은 건강한 대조군보다 흑인 소아 류마티스 관절염 환자에서 더 높은 빈도를 나타냈다. 이어서, 본 연구에서는 소아 류마티스 관절염 환자와 건강한 대조군에서 적응 면역 레퍼토리의 다양성을 추정했다. T 세포 수용체 (T cell receptor, TCR) 레퍼토리의 알파 다양성은 건강한 피험자보다 소아 류마티스 관절염 환자 내에서 유의하게 낮았으며, 베타 다양성은 다른 그룹의 쌍을 이룬 샘플보다 쌍을 이룬 소아 류마티스 관절염 환자의 샘플 사이에서 유의하게 높았다. 본 연구의 발견은 소아 류마티스 관절염의 병인과 이에 영향을 주는 면역학적 환경에 대한 새로운 통찰력을 제공할 수 있다.